７月２８日発生の地震により、運休が続いていた熊本県のＪＲ鹿児島線宇土（宇土市）-八代（八代市）間で１０日、運行が再開された。ＪＲの在来線は７４日ぶりの全線復旧。同区間は通学利用が多く、９日まで代行バスの運行と、９月に先駆けて全通した九州新幹線による振り替え輸送を実施していた。

　ＪＲ九州によると、運休区間では、軌道の変形や電柱の損傷など大きな被害が出たため、損傷したレールの交換や新しい電柱、架線の取り付けなどの作業を進めていた。

　同社は宇土-八代間で８月２６日からバスを運行。ただ、普通列車なら片道３０分ほどの所要時間が、バスは約１時間５０分かかり、通勤・通学客に支障が出ていた。９月１８日以降は新幹線の熊本-新八代間が特急券なしで利用できるようになった。